インボイス制度の仕入税額控除に対応した法人向け会計ソフト 2選を比較【2026年版】

仕入税額控除とは？

仕入税額控除とは、売上げにかかる消費税額から、仕入れなどにかかる消費税額を引いて、納める税額を計算する仕組みです [5]

課税仕入れとは？

課税仕入れとは、事業者が事業のために、他の者から資産を譲り受けたり借りたり、サービスの提供を受けたりすることです [5]

適格請求書とは？

適格請求書とは、売り手が買い手に、税率と消費税額を正しく伝えるために出す、決まった項目のある請求書や納品書です [7]

消費税は、売上げにかかる消費税額から、仕入れなどにかかる消費税額を引いて計算します [5]。この引く部分が、仕入税額控除です [5]。

商品の購入、広告宣伝費、外注費などが課税仕入れになります [5]。給与等の支払は、課税仕入れに入りません [5]。

令和5年10月1日に、インボイス制度（適格請求書等保存方式）が始まりました [7]。仕入税額控除を受けるには、帳簿と適格請求書などの請求書等を保存します [7]。適格請求書は、税務署長の登録を受けた事業者だけが交付できます [7]。

請求書等には、適格請求書や適格簡易請求書のほか、仕入明細書等と電子データも入ります [6]。帳簿と請求書等は、両方の保存が必要です [6]。

保存は7年間で、数え始める日は帳簿と請求書等で違います [6]。6年目と7年目は、どちらか一方の保存で足ります [6]。

一部の取引は、帳簿だけの保存で控除が認められます。公共交通機関の運送や、自動販売機での購入などです [6]。令和5年10月1日から令和11年9月30日までは、金額が少ない課税仕入れにも、帳簿だけで済む特例があります [6]。対象は、売上高が一定以下の事業者です [6]。

免税事業者などからの仕入れは、そのままでは控除できません [7]。ただし、令和5年10月1日から令和13年9月30日までは、税額の一部を控除できる経過措置があります [7]。経過措置を使える範囲には上限があり、令和8年10月1日以後に始まる課税期間では上限が変わります [7]。

税額は、インボイスに書かれた消費税額を積み上げる方法か、税率ごとの合計から割り戻す方法で計算します [7]。売上げ側で積み上げ計算を選んだら、仕入れ側も積み上げ計算です [7]。

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• freee会計のスタンダードを1年使う場合: 計算式: 税込9,878円/月 × 12か月 = 税込118,536円（2026-10-31時点の料金から計算）
• 弥生会計 Nextのエントリー（年契約）を1年使う場合: 計算式: 税込3,190円/月 × 12か月 = 税込38,280円（2026-10-31時点の料金から計算）
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計算に使った料金は上の比較表の値です。freee会計は従量課金が別にかかり、弥生会計 Nextは追加ユーザー料金がかかることがあります。実際の請求額はオプション・契約形態で変わることがあります。